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11 変異株PCR検査 (8 ページ)
出典
公開元URL | https://www.bousai.metro.tokyo.lg.jp/taisaku/saigai/1021348/1021633.html |
出典情報 | 東京都新型コロナウイルス感染症モニタリング会議資料(第88回 5/26)《東京都》 |
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オミクロン株亜系統「BA.5系統」「BA.2.12.1系統」の検査フロー
経過日数
PCR検査(コロナ陽性が判明)
1日
変異株PCR検査(迅速かつ幅広く特異な変異の有無を確認)
全国的に行われていた変異株PCR検査
○「L452R」変異に着目
「L452R」陽性:デルタ株疑い
「L452R」陰性:オミクロン株疑い
1日
健安研独自の変異株PCR検査
〇「E484A」が陽性:オミクロン株疑い
○「L452」の変異に注目
⇒L452Rの場合:BA.4又はBA.5の疑い
○ 膜タンパク質の「D3N」の変異に注目
⇒変異あり(D3N):BA.5疑い
⇒変異なし(D3D):BA.4疑い
〇L452Rではないが、L452の変異がある
⇒L452Qの可能性(BA.2.12.1疑い)
デルタ
主な
変異
3日
〜
7日
L452R
オミクロン
BA.1
E484A
ins214EPE
BA.2
BA.4
BA.5
BA.2.12.1
E484A
L452R
E484A
D3D
L452R
E484A
D3N
L452Q
E484A
ゲノム解析(詳細の遺伝子解析を行い変異を把握)(※)
⇒オミクロン株の系統(BA.4、BA.5、BA.2.12.1等)を 確定
※ゲノム解析は、ウイルス量が一定以上必要
経過日数
PCR検査(コロナ陽性が判明)
1日
変異株PCR検査(迅速かつ幅広く特異な変異の有無を確認)
全国的に行われていた変異株PCR検査
○「L452R」変異に着目
「L452R」陽性:デルタ株疑い
「L452R」陰性:オミクロン株疑い
1日
健安研独自の変異株PCR検査
〇「E484A」が陽性:オミクロン株疑い
○「L452」の変異に注目
⇒L452Rの場合:BA.4又はBA.5の疑い
○ 膜タンパク質の「D3N」の変異に注目
⇒変異あり(D3N):BA.5疑い
⇒変異なし(D3D):BA.4疑い
〇L452Rではないが、L452の変異がある
⇒L452Qの可能性(BA.2.12.1疑い)
デルタ
主な
変異
3日
〜
7日
L452R
オミクロン
BA.1
E484A
ins214EPE
BA.2
BA.4
BA.5
BA.2.12.1
E484A
L452R
E484A
D3D
L452R
E484A
D3N
L452Q
E484A
ゲノム解析(詳細の遺伝子解析を行い変異を把握)(※)
⇒オミクロン株の系統(BA.4、BA.5、BA.2.12.1等)を 確定
※ゲノム解析は、ウイルス量が一定以上必要