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資料２-３_中村構成員提出資料 (12 ページ)
出典
| 公開元URL | https://www.mhlw.go.jp/stf/newpage_33877.html |
| 出典情報 | 今後のがん研究のあり方に関する有識者会議（第12回 6／28）《厚生労働省》 |
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ネオアンチゲン
体細胞変異
エキソーム解析
腫瘍 DNA
正常 DNA
HiSeq
Sequencer
変異しているアミノ酸を含む
新規免疫抗原（ネオアンチゲン）
予測が可能
・
・
アミノ酸
R367M
P998L
V1129M
S387L
R58Q
R424W
L1903F
V548I
H88Y
S553F
C242Y
・
・
・・・
Illumina Novaseq
HLA
遺伝子
ABCB5
AGRN
ATP8B3
GPLD1
INPP5B
LAD1
LRP1B
PKD2L1
RHOXF2B
RP11
TP53
変異
1100G>T
2993C>T
3385G>A
1160C>T
173G>A
1270C>T
5709G>C
1642G>A
262C>T
1658C>T
725G>A
・
・
ゲノム情報に基づいて、人のがん細胞にお
けるすべてのタンパク質の変化からネオアン
チゲン＝がん細胞の目印が予測できる
Mutation
PKD2L1
GPLD1
RP11
TP53
LAD1
LRP1B
変異ペプチド(nM)
正常ペプチド(nM)
V548I
AYFVTYVFFI 31 AYFVTYVFFV
201
S387L PYARLGWAMTL 56 PYARLGWAMTS 3,844
S553F
KFLAAAHNF
56
KFLAAAHNS 19,392
C242Y SYMGGMNRRPI 82 SCMGGMNRRPI 14,551
R424W SWGLPCTELF 84 SRGLPCTELF 12,175
L1903F AFMPISGTSF 108 ALMPISGTSF
1,689
体細胞変異
エキソーム解析
腫瘍 DNA
正常 DNA
HiSeq
Sequencer
変異しているアミノ酸を含む
新規免疫抗原（ネオアンチゲン）
予測が可能
・
・
アミノ酸
R367M
P998L
V1129M
S387L
R58Q
R424W
L1903F
V548I
H88Y
S553F
C242Y
・
・
・・・
Illumina Novaseq
HLA
遺伝子
ABCB5
AGRN
ATP8B3
GPLD1
INPP5B
LAD1
LRP1B
PKD2L1
RHOXF2B
RP11
TP53
変異
1100G>T
2993C>T
3385G>A
1160C>T
173G>A
1270C>T
5709G>C
1642G>A
262C>T
1658C>T
725G>A
・
・
ゲノム情報に基づいて、人のがん細胞にお
けるすべてのタンパク質の変化からネオアン
チゲン＝がん細胞の目印が予測できる
Mutation
PKD2L1
GPLD1
RP11
TP53
LAD1
LRP1B
変異ペプチド(nM)
正常ペプチド(nM)
V548I
AYFVTYVFFI 31 AYFVTYVFFV
201
S387L PYARLGWAMTL 56 PYARLGWAMTS 3,844
S553F
KFLAAAHNF
56
KFLAAAHNS 19,392
C242Y SYMGGMNRRPI 82 SCMGGMNRRPI 14,551
R424W SWGLPCTELF 84 SRGLPCTELF 12,175
L1903F AFMPISGTSF 108 ALMPISGTSF
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