データベース構築に関する進捗状況 ～A班～

(進捗：6/20→7/20)

1_データベース構築

＜全体＞
 FASTQデータ受領数（T/Nペア確定数） R3年度：1,437 → 1,448 R4年度：0 → 69
 データ確定数（QC完了数）
N：814 → 1,209、T：815 → 1,210
R3年度
代表機関・代表者

国立がん
研究
センター

出検数
計画：500症例
WGS

角南
久仁子

浦上
研一

RNA
-seq

RNA
-seq
WGS

がん研
有明病院

上野
貴之

FASTQ データ
受領数
(T/Nペア確定数)

データ確定数
(QC完了数)
塩基数，QV

出検数
計画：600+α症例

FASTQ データ
受領数
(T/Nペア確定数)

499 → 499

N:500/500,500/500
T:501/501,501/501※

０→24

0

データ確定数
(QC完了数)
塩基数，QV

前向き症例の
同意取得数

42 → 42

WGS
静岡がん
センター

500
（出検完了）

R4年度

RNA
-seq

478
（出検完了）

500
（出検完了）

500
（出検完了）

535
（出検完了）

535
（出検完了）

0

450 → 452

N:323/323, 323/323
T:323/323, 323/323

０→24

0

110→161

0
113 → 202
（分担機関を含む）

0

488 → 497

N:386/386, 386/386
T:367/386, 386/386

0

0

118→159

0 → 69
116 → 181
（分担機関を含む）

0

118→149

0

※角南班：500症例の中に重複がん（1症例で腫瘍検体が2つ）が2症例含まれるため、腫瘍検体（T）受領数は502の予定。
注１：FASTQデータは、症例IDに基づきペアをカウント
注２：QCは、研究班から提供されたペアリストを元に集計
注３：分割納品によるデータ統合が必要な症例の統合前のものが一部症例に含まれる。(それらの症例は塩基数が不足）

3