PRISM事業の現状
取組①

データ収集

全ゲノムを含む多層化オミックスデータ及び臨床情報を収集
特発性肺線維症（IPF）
世界初の臨床情報が紐づいたオミックスデータのデータベースを構築（R3に1,308症例見込み）。
肺がん患者
米国のTCGA（1,089症例）を上回る1,624症例のデータベースを構築。
診療テキスト構造化システム
IPF、肺がんについて、オントロジー、アノテーション・コーパス、知識ベースの整備を行い、
医療分野テキストを高度に解析・構造化する言語・知識処理基盤を構築。

取組②

データ解析

対象疾患患者データから創薬ターゲットを探索する技術を複数開発

患者層別化 診療情報及びオミックスデータという異種のデータを入力し、症状等に密接に関連した生体分子を特定。
バーチャル創薬・臨床試験 新薬に対して、マウス遺伝子発現からヒトでのアウトカムを予測。
疾患特異的サブネットワーク 公共DBから構築した遺伝子ネットワークに患者データをマッピングして層別化。
創薬ターゲットを共有する疾患予測 遺伝子発現データから算出した疾患ごとの類似度を用いた創薬標的探索。
深層学習を使った解析システム 深層学習技術を活用してオミックスデータをマルチモーダルに解析。
取組③

結果解釈

文献等の既存知識の調査を効率化するためのツールを構築又は開発中
TargetMine
IPFと肺がんのデータを追加し、結果解釈に利用。
産総研のシステム
文献から知識ベースを構築し、そこから分子機能や分子間作用を推定するシステムを開発中。
取組①～③による成果

IPFと肺がんでこれまで報告されていない分子/パスウェイを見出した！
創薬ターゲット候補
特発性肺線維症（IPF）
IPFでの関与が報告されていない分子/パスウェイを見出した（用途特許出願済み1件、出願予定1件）。ヒト肺疾患部での発現を確
認（免疫染色）したほか、家族性IPFの遺伝子変異導入マウスでの実験や患者でのメタボローム解析などを実施し、検証中。
肺がん患者
Pan-negative肺がんの創薬ターゲットを探索し、関与が報告されていない重要分子1つを見出した。今回同定された分子は、全ゲ
ノムデータ・ChIP-seqデータ・RNA-seqデータを統合的に解析しない限り同定は困難であった（全ゲノム解析を中核とした多層
化オミックスデータをマルチモーダルに解析する重要性を立証）。現在PDXマウスで検証中。

9