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資料2 全ゲノム解析等に係るAMED研究について (6 ページ)
出典
公開元URL | https://www.mhlw.go.jp/stf/newpage_31469.html |
出典情報 | 厚生科学審議会 科学技術部会全ゲノム解析等の推進に関する専門委員会(第14回 3/9)《厚生労働省》 |
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エキスパートパネル体制構築班の進捗状況
~A班~
(1/20→2/20)
2_エキスパートパネル
項目
角南班
浦上班
上野班
全体
エキスパートパネル実施数
240 → 263
242 → 317
522 → 583
1,004 → 1,163
WGS解析により検出された診療に関連する遺伝子異常
Actionable genomic
alterationの検出数
139 → 156
115 → 143
313 → 342
567 → 641
生殖細胞系列に開示対象の病的
バリアントの検出数
20 → 22
4 → 11
31 → 44
55 → 77
WGSを用いたエキスパートパネルにより得られた成果
⚫ 既存の検査では検出できないがんに関与するゲノム異常の検出
✓
✓
✓
✓
long insertion/deletion変異( CDKN2A , CDKN2B, CHEK2, TP53, CDK12, RB1, ARID1Aなど)
inversion変異(BRCA1, RB1)
病的と強く疑えるバリアント(BRCA2)
染色体レベルでの異常(染色体破砕、全ゲノム倍加、転座等)
⚫ 全ゲノム解析の結果が診断や治療に有用であった例
✓
構造異常や融合遺伝子を、多様で診断が難しい希少がん(肉腫等※)などの診断や予後に活用
- 頭頸部腫瘍(篩骨洞)の組織型不明症例において、融合遺伝子の検出によりBiphenotypic sinonasal sarcomaと診断
※)腺様嚢胞癌, 孤発性線維性腫瘍, 骨外性ユーイング肉腫, 悪性末梢神経鞘腫, 類上皮血管内皮腫瘍, 脱分化型脂肪肉腫,
滑膜肉腫, 胞巣状軟部肉腫など
✓
融合遺伝子の確認検査後、推奨薬剤を投与し有効性あり
⚫ がん以外の疾患に関与する可能性が高いゲノム異常の検出
✓
生殖細胞系列において非腫瘍関連遺伝子(循環器疾患等)を検出
WGSを用いた患者還元
✓
✓
確認検査実施後に実際に治療や治験に結びついた症例:5 → 10症例
基本コホートの研究用CGP検査を実施した症例: 26 → 63症例
6
~A班~
(1/20→2/20)
2_エキスパートパネル
項目
角南班
浦上班
上野班
全体
エキスパートパネル実施数
240 → 263
242 → 317
522 → 583
1,004 → 1,163
WGS解析により検出された診療に関連する遺伝子異常
Actionable genomic
alterationの検出数
139 → 156
115 → 143
313 → 342
567 → 641
生殖細胞系列に開示対象の病的
バリアントの検出数
20 → 22
4 → 11
31 → 44
55 → 77
WGSを用いたエキスパートパネルにより得られた成果
⚫ 既存の検査では検出できないがんに関与するゲノム異常の検出
✓
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long insertion/deletion変異( CDKN2A , CDKN2B, CHEK2, TP53, CDK12, RB1, ARID1Aなど)
inversion変異(BRCA1, RB1)
病的と強く疑えるバリアント(BRCA2)
染色体レベルでの異常(染色体破砕、全ゲノム倍加、転座等)
⚫ 全ゲノム解析の結果が診断や治療に有用であった例
✓
構造異常や融合遺伝子を、多様で診断が難しい希少がん(肉腫等※)などの診断や予後に活用
- 頭頸部腫瘍(篩骨洞)の組織型不明症例において、融合遺伝子の検出によりBiphenotypic sinonasal sarcomaと診断
※)腺様嚢胞癌, 孤発性線維性腫瘍, 骨外性ユーイング肉腫, 悪性末梢神経鞘腫, 類上皮血管内皮腫瘍, 脱分化型脂肪肉腫,
滑膜肉腫, 胞巣状軟部肉腫など
✓
融合遺伝子の確認検査後、推奨薬剤を投与し有効性あり
⚫ がん以外の疾患に関与する可能性が高いゲノム異常の検出
✓
生殖細胞系列において非腫瘍関連遺伝子(循環器疾患等)を検出
WGSを用いた患者還元
✓
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確認検査実施後に実際に治療や治験に結びついた症例:5 → 10症例
基本コホートの研究用CGP検査を実施した症例: 26 → 63症例
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