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資料3-2 難病の全ゲノム解析等の進捗状況 (5 ページ)
出典
公開元URL | https://www.mhlw.go.jp/stf/newpage_23993.html |
出典情報 | 厚生科学審議会 科学技術部会全ゲノム解析等の推進に関する専門委員会(第8回 3/2)《厚生労働省》 |
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ゲノムデータ解析について(1)
• コントロール群ゲノムの解析法に準じたプロトコルで実施
• GATK Best Practiceに準じたgermlineバリアントパイプ
ライン
• GATKの互換アルゴリズムをGPUで実行:
Parabricks(v3.1, GATK4.1互換)で解析
• 遺伝研スパコン個人ゲノム解析環境およびオンプレミス
サーバーで実行
5
【國土班 徳永研究分担者資料(難病対策課により一部改変)】
• コントロール群ゲノムの解析法に準じたプロトコルで実施
• GATK Best Practiceに準じたgermlineバリアントパイプ
ライン
• GATKの互換アルゴリズムをGPUで実行:
Parabricks(v3.1, GATK4.1互換)で解析
• 遺伝研スパコン個人ゲノム解析環境およびオンプレミス
サーバーで実行
5
【國土班 徳永研究分担者資料(難病対策課により一部改変)】