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資料2 全ゲノム解析等に係るAMED研究について(中間報告) (10 ページ)
出典
公開元URL | https://www.mhlw.go.jp/stf/newpage_28954.html |
出典情報 | 厚生科学審議会 科学技術部会 全ゲノム解析等の推進に関する専門委員会(第12回 11/15)《厚生労働省》 |
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C班(解析班)進捗状況
(10/20時点)
集中管理チーム
実施項目
3_C班
○:開始予定 ●:終了予定
○:開始予定 ●:終了予定
月
:完了
:実施中
:完了
:実
進捗状況
4 5 6 7 8 9 10 11 12 1 2 3
WGSデータ、臨床情報、検体及び検体情報を紐付けて管理するシステムの構築
1 システム要件検討/確定作業の実施
○
●
2 要件確定/委託先企業の決定
○
3 システム構築/納品
●
○
●
・井元班で行うゲノムデータ管理システムとの連携・ID共有を実施。
4 システム検証作業
○● ・医療機関から受託会社へのオーダーシートの統一をNGS解析SOP
作成とも連携して実施。
オンラインを活用した試料の登録・匿名化システムの構築
・システム要件の検討作業を実施中。システム設計作業の発注を実
1 仕様の検討
○
● 施。
・バンキングのための研究計画書の作成開始。
バンキングのための統一ICと研究計画書の作成等
・関連機関との定期ミーティングを実施し、がん組織バンク運営体
1 研究計画書の作成、倫理審査の承認
○
● 制の構築を実施中。
がん組織バンク運営事務局の設置と関係機関との連携体制構築
1 運営体制の構築
○
●
組織型別サンプル保管手順書の作成(臓器別検体取扱SOP作成)
1 病理学会での検体採取方法の検証作業の実施
○
●
2 SOPのドラフト作成
○
●
3 SOPの確定作業
○
・ゲノム解析に関する倫理審査は承認。
・日本病理学会と連携し、臓器別検体取扱SOP作成作業を実施中。
●
サンプル輸送・処理プロトコール作成
1
サンプル処理・輸送プロトコールのドラフト
作成
○
●
2 サンプル処理・輸送プロトコールの確定作業
○
●
3 保管のためのBBJのシステム改修
○
●
・プロトコールの作成作業を実施中。
・A班B班に核酸抽出のアンケートを実施し、集計作業を実施中。
・BBJのシステム改修発注作業は準備中。
サンプル輸送・処理プロトコール作成(NGS解析SOP作成)
1
受託会社・解析機関(A/B班)でのSOP(NGS/
核酸抽出)ヒアリング
2 SOPのドラフト作成
3 SOPの確定作業
○
・日本衛生検査所協会と連携し実施中。
・NGS受託会社のヒアリングが完了し、各社のSOPの内容を取りま
●
とめ実施。
○ ● ・NGS解析SOPの骨子を作成。
●
○
10
(10/20時点)
集中管理チーム
実施項目
3_C班
○:開始予定 ●:終了予定
○:開始予定 ●:終了予定
月
:完了
:実施中
:完了
:実
進捗状況
4 5 6 7 8 9 10 11 12 1 2 3
WGSデータ、臨床情報、検体及び検体情報を紐付けて管理するシステムの構築
1 システム要件検討/確定作業の実施
○
●
2 要件確定/委託先企業の決定
○
3 システム構築/納品
●
○
●
・井元班で行うゲノムデータ管理システムとの連携・ID共有を実施。
4 システム検証作業
○● ・医療機関から受託会社へのオーダーシートの統一をNGS解析SOP
作成とも連携して実施。
オンラインを活用した試料の登録・匿名化システムの構築
・システム要件の検討作業を実施中。システム設計作業の発注を実
1 仕様の検討
○
● 施。
・バンキングのための研究計画書の作成開始。
バンキングのための統一ICと研究計画書の作成等
・関連機関との定期ミーティングを実施し、がん組織バンク運営体
1 研究計画書の作成、倫理審査の承認
○
● 制の構築を実施中。
がん組織バンク運営事務局の設置と関係機関との連携体制構築
1 運営体制の構築
○
●
組織型別サンプル保管手順書の作成(臓器別検体取扱SOP作成)
1 病理学会での検体採取方法の検証作業の実施
○
●
2 SOPのドラフト作成
○
●
3 SOPの確定作業
○
・ゲノム解析に関する倫理審査は承認。
・日本病理学会と連携し、臓器別検体取扱SOP作成作業を実施中。
●
サンプル輸送・処理プロトコール作成
1
サンプル処理・輸送プロトコールのドラフト
作成
○
●
2 サンプル処理・輸送プロトコールの確定作業
○
●
3 保管のためのBBJのシステム改修
○
●
・プロトコールの作成作業を実施中。
・A班B班に核酸抽出のアンケートを実施し、集計作業を実施中。
・BBJのシステム改修発注作業は準備中。
サンプル輸送・処理プロトコール作成(NGS解析SOP作成)
1
受託会社・解析機関(A/B班)でのSOP(NGS/
核酸抽出)ヒアリング
2 SOPのドラフト作成
3 SOPの確定作業
○
・日本衛生検査所協会と連携し実施中。
・NGS受託会社のヒアリングが完了し、各社のSOPの内容を取りま
●
とめ実施。
○ ● ・NGS解析SOPの骨子を作成。
●
○
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