3_C班

C班（解析班）進捗状況

(10/20時点)

ゲノム解析チーム
実施項目

○：開始予定 ●：終了予定
○：開始予定 ●：終了予定
月 4 5 6 7 8 9 10 11 12 1 2 3

：完了

：実施中
：完了

：実施

進捗状況

シークエンス企業からのデータ受け取り自動化 解析結果の返却 （統一パイプラインを用いたゲノムデータ解析）
1 データの受け取り

〇

●

1 解析の実施

〇

●

1 解析結果の返却
1 他のチームとの連携
2 データ受け取り自動化

〇

●

〇

●
〇

3 ロングリード対応

●
〇

●

4 統一パイプライン振り返り

〇 ●

・WGSのデータ受取はほぼ完了し、現在はRNAseqを中心にデータ
受け取りが進行中。
・WGSは、約40症例/日 で処理が進行中。RNAseq はパイプライ
ン検証のための試行を繰り返し実施。
・解析結果の返却は進行中。
・データ受け取りのスキーマを整理し、データの整合性確認におけ
る不整合の事例を整理。
・ロングリード解析の受け取りデータについて、310症例で
subreadまで含めて約2PBの受け取りのスキームを検討し、検証
データを用いたパイプラインのチューニングを実施。

統一パイプラインのクラウドでの比較研究
1 課題抽出
2 検証準備

〇 ●
〇●

3 解析環境の構築、性能・コスト検証

〇

・統一パイプラインのクラウドでの比較研究の課題抽出、検証準備
は完了。
・基準計画書の検討やクラウド選定検討、環境構築のための制約条
● 件の整理。クラウドベンダーヒアリング実施。

システム運用・セキュリティ対策
1 課題抽出
2 検証準備
3 プロトタイピング、性能・コスト検証

〇 ●
〇●
〇

●

・システム運用・セキュリティ対策の課題抽出、検証準備は完了。
・基準計画書や検証する攻撃シナリオの検討を実施。調査・検証製
品の選定検討を実施。

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