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資料2 全ゲノム解析等に係るAMED研究について(中間報告) (13 ページ)
出典
公開元URL | https://www.mhlw.go.jp/stf/newpage_28954.html |
出典情報 | 厚生科学審議会 科学技術部会 全ゲノム解析等の推進に関する専門委員会(第12回 11/15)《厚生労働省》 |
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C班(解析班)進捗状況
3_C班
(10/20時点)
レポート作成チーム
○:開始予定 ●:終了予定
○:開始予定 ●:終了予定
実施項目
:完了
:実施中
:完了
:実施
進捗状況
月 4 5 6 7 8 9 10 11 12 1 2 3
患者レポートの作成
1 ゲノム情報と臨床情報の統合ロジ構築 ○●
○
2 レポート様式の確定
●
他施設用
出口戦略コホート内
○ ●
3 臨床試験DBの構築
○
4 レポート作成パイプライン構築
○
5 返却システムの構築
血液がんDB
● ○
●
●○血液がん用 ●
○
●
・レポート様式は確定し、既存の臨床試験DBやレポート作成
パイプライン、レポート返却システムの構築が完了。
引き続き造血器腫瘍用のロジを構築中。東大医科研で作成し
たVCFの確認、造血器腫瘍用の臨床試験DBを構築や造血器腫
瘍用のパイプライン改変を実施中。
6 レポート返却
SOPや運用体制を確立
1 全ゲノムレポート作成運用体制の構築 ○
●
データ共有チーム
実施項目
進捗状況
月 4 5 6 7 8 9 10 11 12 1 2 3
ゲノムデータ、臨床情報の抽出APIを備えたデータ共有システムの構築
1 課題の抽出・検討
2
〇 ●
ゲノム・臨床情報登録等、運用体制の検
討・実施
〇
●
3 振り返り、さらなる課題抽出、まとめ
〇 ●
・PoC実施に向けた課題抽出が完了。
・EDC/ゲノムデータの取り込み試験やセキュリティ基盤の構築に
着手。
APIを経由したアプリケーション構築
1 課題の抽出・検討
〇 ●
2 レポート作成システムとの連携、PoC実施
〇
●
患者還元補助システムの開発・連携、PoC
実施
〇
●
3
4 振り返り、さらなる課題抽出、まとめ
〇 ●
・PoC実施に向けた課題抽出が完了。
・レポート連携の接続調整や例示アプリケーション(IGV閲覧等の
機能を含む)の構築に着手。
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3_C班
(10/20時点)
レポート作成チーム
○:開始予定 ●:終了予定
○:開始予定 ●:終了予定
実施項目
:完了
:実施中
:完了
:実施
進捗状況
月 4 5 6 7 8 9 10 11 12 1 2 3
患者レポートの作成
1 ゲノム情報と臨床情報の統合ロジ構築 ○●
○
2 レポート様式の確定
●
他施設用
出口戦略コホート内
○ ●
3 臨床試験DBの構築
○
4 レポート作成パイプライン構築
○
5 返却システムの構築
血液がんDB
● ○
●
●○血液がん用 ●
○
●
・レポート様式は確定し、既存の臨床試験DBやレポート作成
パイプライン、レポート返却システムの構築が完了。
引き続き造血器腫瘍用のロジを構築中。東大医科研で作成し
たVCFの確認、造血器腫瘍用の臨床試験DBを構築や造血器腫
瘍用のパイプライン改変を実施中。
6 レポート返却
SOPや運用体制を確立
1 全ゲノムレポート作成運用体制の構築 ○
●
データ共有チーム
実施項目
進捗状況
月 4 5 6 7 8 9 10 11 12 1 2 3
ゲノムデータ、臨床情報の抽出APIを備えたデータ共有システムの構築
1 課題の抽出・検討
2
〇 ●
ゲノム・臨床情報登録等、運用体制の検
討・実施
〇
●
3 振り返り、さらなる課題抽出、まとめ
〇 ●
・PoC実施に向けた課題抽出が完了。
・EDC/ゲノムデータの取り込み試験やセキュリティ基盤の構築に
着手。
APIを経由したアプリケーション構築
1 課題の抽出・検討
〇 ●
2 レポート作成システムとの連携、PoC実施
〇
●
患者還元補助システムの開発・連携、PoC
実施
〇
●
3
4 振り返り、さらなる課題抽出、まとめ
〇 ●
・PoC実施に向けた課題抽出が完了。
・レポート連携の接続調整や例示アプリケーション(IGV閲覧等の
機能を含む)の構築に着手。
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