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資料3-1 全ゲノム解析等に係る厚生労働科学研究について (23 ページ)
出典
公開元URL | https://www.mhlw.go.jp/stf/newpage_23226.html |
出典情報 | 厚生科学審議会 科学技術部会全ゲノム解析等の推進に関する専門委員会(第7回 1/18)《厚生労働省》 |
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(続き)
システム基盤のプロトタイピングにおいては、以下の観点でクラウドサービス毎に比較検討を行うこと。
性能検証
• 最低限の性能要件の条件のもと、解析速度を単純比較
• シークエンス量などの条件変更による、計算効率・費用の変化
• 性能向上を阻害する要因の特定
費用検証
• データのバックアップ、変異のアノテーションなど種々の用途を考慮したFASTQ、BAM(CRAM)、VCF
などのゲノムデータ保管費用の比較
• 解析後データをオンプレミスの環境にダウンロードし保管をする場合と、クラウド上にデータ保管を続け
る場合の費用を比較
• 月次に解析作業を同時並行で1000 検体程度行うことを条件とし、月次のクラウド費用を比較
有用性検証(定性的)
• システム構築上の課題
• システム運用(システム監視やデータバックアップ、ユーザビリティ・自動化、リスクなど)における課
題整理
• システム障害やセキュリティインシデントへの対応の状況
• システムの証跡管理の状況
• システムの構成管理の状況(アップデーター更新などの保守)
• 費用管理
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システム基盤のプロトタイピングにおいては、以下の観点でクラウドサービス毎に比較検討を行うこと。
性能検証
• 最低限の性能要件の条件のもと、解析速度を単純比較
• シークエンス量などの条件変更による、計算効率・費用の変化
• 性能向上を阻害する要因の特定
費用検証
• データのバックアップ、変異のアノテーションなど種々の用途を考慮したFASTQ、BAM(CRAM)、VCF
などのゲノムデータ保管費用の比較
• 解析後データをオンプレミスの環境にダウンロードし保管をする場合と、クラウド上にデータ保管を続け
る場合の費用を比較
• 月次に解析作業を同時並行で1000 検体程度行うことを条件とし、月次のクラウド費用を比較
有用性検証(定性的)
• システム構築上の課題
• システム運用(システム監視やデータバックアップ、ユーザビリティ・自動化、リスクなど)における課
題整理
• システム障害やセキュリティインシデントへの対応の状況
• システムの証跡管理の状況
• システムの構成管理の状況(アップデーター更新などの保守)
• 費用管理
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