新型コロナウイルスゲノムサーベイランスにおけるBA.5検出の推定

BA.5検出率および推定検出率の解析
•

ゲノム解析データを基に、PANGO lineageを決定（病原体ゲノム解析研究センターで実施）して集計。

•

第20疫学週から第34疫学週までのBA.5系統(以下、BA.5という）検出数および総ゲノム解析数（解析不能分を除く）をもとに解析し、直近
1週前の週までを検出割合として図示

•

BA.5系統にPANGO lineage上の亜系統であるBEおよびBFの両系統を加えて解析を行った。

•

全てのウイルスがオミクロン株BA.5に置き換わることを前提に、Lineageが判明した検体数に占めるBA.5の割合をロジスティック成長モデ
ルにフィットさせ、週ごとの推定を行った。また、各系統・株の検出割合を多項ロジスティック回帰モデルにフィットさせ、週ごとの検出
割合の推定を行った。

解釈に当たってのコメント
•

全国の自治体から報告され、国立感染症研究所で集計されたデータには、孤発例やクラスター事例など様々な検体が混在していると考えら
れるが、BA.5系統の置き換わりの動向が把握できると考えられる。

•

実際のBA.5検出の推移と本解析との検証が必要であると考えられる。

106