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資料2ー1 全ゲノム解析等のデータ利活用ポリシー(案) (10 ページ)
出典
公開元URL | https://www.mhlw.go.jp/stf/newpage_33324.html |
出典情報 | 厚生科学審議会 科学技術部会全ゲノム解析等の推進に関する専門委員会(第15回 5/25)《厚生労働省》 |
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第 15 回全ゲノム解析等の推進に関する専門委員会
資料 2-1
令和 5 年 5 月 25 日
令和5年5月 25 日時点
令和5年○○月○○日規程第○号
別紙1.1
全ゲノム解析等のデータの利用許諾等の対象となるゲノム情報及び臨床情報
(がんゲノム版)(案)
【ゲノム情報】
ゲノム情報1: 検査結果に記載される遺伝子変化(全ゲノムレポートに掲載されるもの)
ゲノム情報2: シークエンスセンターからのシークエンスデータ(FASTQ データ)、統一
解析パイプラインによって生成された BAM 又は CRAM ファイル。解析・
データセンターで再作成した VCF ファイルも提供可能。
【臨床情報】
<症例基本情報・同意情報>
患者基本情報
施設番号(ID*)、プロジェクト番号(ID)、症例番号、性別、年齢、
人種、身長、体重、BMI、固形腫瘍/造血器腫瘍、これまでの登録の
有無、過去に他プロジェクトで WGS 解析を行った際の腫瘍部検体識
別 ID、症例関係区分(重複がん等)
、施設症例管理番号
がん種情報
がん種区分(固形腫瘍)
:疾患名(Oncotree)
がん種区分(造血器腫瘍)
:がん種区分(WHO 分類)
登録情報
症例識別 ID(施設 ID+PJ 番号+症例番号)
、登録日
がんゲノムプロ
C-CAT 登録 ID
ファイリング検
査登録
<検体データインポート情報 (Excel ファイルをインポートした際の自動登録情報)>
施設番号、プロジェクト番号、症例番号、腫瘍・非腫瘍、検体番号、核酸種類、取込日時、
取込作業者、結果
<検体情報 (固形腫瘍) >
検体情報
腫瘍/非腫瘍、DNA/RNA、検体番号、検体識別 ID、腫瘍細胞含有
割合、検体採取日、検体採取方法、採取部位、
(原発巣/転移巣)、具
体的な採取部位(脊髄、脳等)
、解析不良の有無、解析不良の理由
<検体情報 (造血器腫瘍) >
検体情報
腫瘍/非腫瘍、DNA/RNA、検体番号、検体識別番号、検体種類(骨
髄液等)
、検体形態(FFPE 等)、腫瘍細胞含有割合、腫瘍割合算定根
拠、検体採取日、検体採取方法、具体的な採取部位、腫瘍組織検体採
取時点における同種移植歴、解析不良の有無、解析不良の理由
10
資料 2-1
令和 5 年 5 月 25 日
令和5年5月 25 日時点
令和5年○○月○○日規程第○号
別紙1.1
全ゲノム解析等のデータの利用許諾等の対象となるゲノム情報及び臨床情報
(がんゲノム版)(案)
【ゲノム情報】
ゲノム情報1: 検査結果に記載される遺伝子変化(全ゲノムレポートに掲載されるもの)
ゲノム情報2: シークエンスセンターからのシークエンスデータ(FASTQ データ)、統一
解析パイプラインによって生成された BAM 又は CRAM ファイル。解析・
データセンターで再作成した VCF ファイルも提供可能。
【臨床情報】
<症例基本情報・同意情報>
患者基本情報
施設番号(ID*)、プロジェクト番号(ID)、症例番号、性別、年齢、
人種、身長、体重、BMI、固形腫瘍/造血器腫瘍、これまでの登録の
有無、過去に他プロジェクトで WGS 解析を行った際の腫瘍部検体識
別 ID、症例関係区分(重複がん等)
、施設症例管理番号
がん種情報
がん種区分(固形腫瘍)
:疾患名(Oncotree)
がん種区分(造血器腫瘍)
:がん種区分(WHO 分類)
登録情報
症例識別 ID(施設 ID+PJ 番号+症例番号)
、登録日
がんゲノムプロ
C-CAT 登録 ID
ファイリング検
査登録
<検体データインポート情報 (Excel ファイルをインポートした際の自動登録情報)>
施設番号、プロジェクト番号、症例番号、腫瘍・非腫瘍、検体番号、核酸種類、取込日時、
取込作業者、結果
<検体情報 (固形腫瘍) >
検体情報
腫瘍/非腫瘍、DNA/RNA、検体番号、検体識別 ID、腫瘍細胞含有
割合、検体採取日、検体採取方法、採取部位、
(原発巣/転移巣)、具
体的な採取部位(脊髄、脳等)
、解析不良の有無、解析不良の理由
<検体情報 (造血器腫瘍) >
検体情報
腫瘍/非腫瘍、DNA/RNA、検体番号、検体識別番号、検体種類(骨
髄液等)
、検体形態(FFPE 等)、腫瘍細胞含有割合、腫瘍割合算定根
拠、検体採取日、検体採取方法、具体的な採取部位、腫瘍組織検体採
取時点における同種移植歴、解析不良の有無、解析不良の理由
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