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資料2-①全ゲノム解析等に係る事業実施準備室の検討状況 (36 ページ)
出典
公開元URL | https://www.mhlw.go.jp/stf/newpage_35569.html |
出典情報 | 厚生科学審議会 科学技術部会全ゲノム解析等の推進に関する専門委員会(第17回 10/3)《厚生労働省》 |
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2023/9/25時点
3.報告事項(3)解析・データセンター運営チームからの報告
がん・難病統合方針(検討結果サマリ)
領域ごとの統合方針
大
判断理由と今後検討事項
統合可
統合に向け検討
準備室で統合に向けた
具体的検討を開始
実際に統合が可能か、
関係者で詳細検討を継続
① 同意取得・管理
④-1 シークエンス解析
④-2 変異検出
② 集中管理・問合せ
③-1 検体情報管理
④-3 ゲノムデータ管理・保存
⑦-1 二次解析
⑦-2 利活用
⑤ 臨床情報の収集・管理・保存
Impact
統合不可
統合可
領域ごとの整備を目指す
⑥ 解析結果標準レポート
統
合
可
① 同意取得・
管理
• 同一システムが利用可能
④-1 シークエン
ス解析
• 受託会社とのやり取りを統一可能
④-2 変異
検出
⑤ 臨床情報の • 医療機関との連携のタイミングが領域に
収集・管理・保存
よって異なり、AMED研究班と検討が必要
② 集中管理・
問合せ
⑦-1 二次解析
Implement
る部分を明らかにした上で整備が必要
• PoCの結果、利活用ユースケースを踏まえ、
統合判断、スケジュールについて決定
⑥ 解析結果標 • 両領域で、プロセス、使用ツール、DBとも
③-2 検体保管
容易
• 両領域の共通ID採番ルールの検討が必
要。R6年度4月の導入を目指す
統
合 ③-1 検体情報 • 両領域の共通ID採番ルールの検討が必
管理
要
に
向
け ④-3 ゲノムデータ • 統合DBの構築は可能。ただし、既存データ
管理・保存
移行方式の難易度・コストの確認が必要
検
討
• 各領域の解析方式が異なる。共通化でき
⑦-2 利活用
小
• 同一パイプラインを使用可能
困難
統
準レポート
に異なるため、別環境の整備が必要
合
不
• 新規検体の保管場所は統合可能。ただし、
可 ③-2 検体保管
既存検体の移行は関係者と継続議論
36
3.報告事項(3)解析・データセンター運営チームからの報告
がん・難病統合方針(検討結果サマリ)
領域ごとの統合方針
大
判断理由と今後検討事項
統合可
統合に向け検討
準備室で統合に向けた
具体的検討を開始
実際に統合が可能か、
関係者で詳細検討を継続
① 同意取得・管理
④-1 シークエンス解析
④-2 変異検出
② 集中管理・問合せ
③-1 検体情報管理
④-3 ゲノムデータ管理・保存
⑦-1 二次解析
⑦-2 利活用
⑤ 臨床情報の収集・管理・保存
Impact
統合不可
統合可
領域ごとの整備を目指す
⑥ 解析結果標準レポート
統
合
可
① 同意取得・
管理
• 同一システムが利用可能
④-1 シークエン
ス解析
• 受託会社とのやり取りを統一可能
④-2 変異
検出
⑤ 臨床情報の • 医療機関との連携のタイミングが領域に
収集・管理・保存
よって異なり、AMED研究班と検討が必要
② 集中管理・
問合せ
⑦-1 二次解析
Implement
る部分を明らかにした上で整備が必要
• PoCの結果、利活用ユースケースを踏まえ、
統合判断、スケジュールについて決定
⑥ 解析結果標 • 両領域で、プロセス、使用ツール、DBとも
③-2 検体保管
容易
• 両領域の共通ID採番ルールの検討が必
要。R6年度4月の導入を目指す
統
合 ③-1 検体情報 • 両領域の共通ID採番ルールの検討が必
管理
要
に
向
け ④-3 ゲノムデータ • 統合DBの構築は可能。ただし、既存データ
管理・保存
移行方式の難易度・コストの確認が必要
検
討
• 各領域の解析方式が異なる。共通化でき
⑦-2 利活用
小
• 同一パイプラインを使用可能
困難
統
準レポート
に異なるため、別環境の整備が必要
合
不
• 新規検体の保管場所は統合可能。ただし、
可 ③-2 検体保管
既存検体の移行は関係者と継続議論
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