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【資料３】薬剤耐性ワンヘルス動向調査年次報告書2024（サマリ版、たたき台） (28 ページ)
出典
| 公開元URL | https://www.mhlw.go.jp/stf/newpage_47987.html |
| 出典情報 | 薬剤耐性ワンヘルス動向調査検討会（第12回 1／8）《厚生労働省》 |
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本邦の下水処理場（水再生センター）放流水のメタゲノム解析（Metagenomic DNA-Seq）
2018 年夏（18S）から年２回の調査にて 2023 年夏（23S）までの計 11 回の期間において自治体から提供され
た処理放流水から検出された各種カテゴリーの薬剤耐性因子（ARG）を RPKM（Reads Per Kilobase of gene
per Million mapped reads）で標準化しました。2018 年以降、ARGs データベースの更新が頻繁に行われてい
るため、全検体から得たメタゲノムデータを改めて ARGs_OAP v3.2.213 で ARGs の RPKM を算出しました。
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2018 年夏（18S）から年２回の調査にて 2023 年夏（23S）までの計 11 回の期間において自治体から提供され
た処理放流水から検出された各種カテゴリーの薬剤耐性因子（ARG）を RPKM（Reads Per Kilobase of gene
per Million mapped reads）で標準化しました。2018 年以降、ARGs データベースの更新が頻繁に行われてい
るため、全検体から得たメタゲノムデータを改めて ARGs_OAP v3.2.213 で ARGs の RPKM を算出しました。
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