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資料3 全ゲノム解析等に係る厚生労働科学研究について (18 ページ)

公開元URL https://www.mhlw.go.jp/stf/newpage_31469.html
出典情報 厚生科学審議会 科学技術部会全ゲノム解析等の推進に関する専門委員会(第14回 3/9)《厚生労働省》
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解析・データセンターWG

解析・データセンターで行うQC
④ 読み取り深度(bam)
平均読み取り深度の分布

平均読み取り深度 (depth)

9,699症例

正常 N

N

腫瘍 T

平均

31.5x

120.9x

中央値

29.7x

116.1x

最小値

4.7x

57.3x

最大値

148.8x

231.2x

T

Normal 30x未満の検体の割合 約53.0%
Tumor 120x未満の検体の割合 約59.5%
18

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