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【参考資料２】薬剤耐性ワンヘルス動向調査報告書2023 (91 ページ)
出典
| 公開元URL | https://www.mhlw.go.jp/stf/newpage_47987.html |
| 出典情報 | 薬剤耐性ワンヘルス動向調査検討会（第12回 1／8）《厚生労働省》 |
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図3
本邦の下水処理場（水再生センター）放流水のメタゲノム解析（Metagenomic DNA-Seq）
2018 年夏（18S）から年２回の調査にて 2022 年夏（22S）までの計 9 回の期間において自治体から提供された処理放流水か
ら検出された各種カテゴリーの薬剤耐性因子（ARG）を RPKM（Reads Per Kilobase of gene per Million mapped reads）で
標準化した。2018 年以降、ARGs データベースの更新が頻繁に行われているため、全検体から得たメタゲノムデータを改めて
ARGs_OAP v3.2.212 で ARGs の RPKM を算出した。
86
本邦の下水処理場（水再生センター）放流水のメタゲノム解析（Metagenomic DNA-Seq）
2018 年夏（18S）から年２回の調査にて 2022 年夏（22S）までの計 9 回の期間において自治体から提供された処理放流水か
ら検出された各種カテゴリーの薬剤耐性因子（ARG）を RPKM（Reads Per Kilobase of gene per Million mapped reads）で
標準化した。2018 年以降、ARGs データベースの更新が頻繁に行われているため、全検体から得たメタゲノムデータを改めて
ARGs_OAP v3.2.212 で ARGs の RPKM を算出した。
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