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【資料２】薬剤耐性ワンヘルス動向調査年次報告書2024（たたき台） (114 ページ)
出典
| 公開元URL | https://www.mhlw.go.jp/stf/newpage_47987.html |
| 出典情報 | 薬剤耐性ワンヘルス動向調査検討会（第12回 1／8）《厚生労働省》 |
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Enterococcus spp.
2021 年に国立感染症研究所が受け入れてゲノム解析を実施した、食品（食肉衛生検査所および検疫
所由来鶏肉検体）から 2016 年から 2021 年にかけて分離された Enterococcus spp.38 株と、国立感染
症研究所薬剤耐性研究センターが日本各地の病院から 2019～2020 年に収集したバンコマイシン耐性腸
球菌（VRE）34 株のゲノムデータから構築したコアゲノム系統樹を図 17 に示した。菌種の内訳は、
Enterococcus gallinarum が 1 株（ヒト由来）と、Enterococcus faecium が 42 株、Enterococcus
faecalis が 29 株であった。E. faecium と E. faecalis は共に食品とヒトの両方から分離された（図
17、図 18）。E. faecium では、ヒト由来の VRE が全て CC17 に分類される一方、食品由来の株で
CC17 に分類されるものはなく、ヒト由来 VRE 株と食品由来株は系統的に分離していることが分かっ
た。E. faecalis でも、ヒト由来の VRE は ST6 か ST179 のいずれかに分類される一方、食品由来の株
では ST6 か ST179 に分類されるものはなく、Enterococcus spp.について、ヒト由来と食品由来の株
は系統的に分離していることが分かった。
VAN
CC
MLST
host
Species
13
Species
MLST
E. faecium
E. faecalis
E. galinarum
14
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16
ヒト
食品
図 17
VAN
vanA
vanB
vanC
vanN
CC17
Enterococcus spp.の食品由来 38 株とヒト由来 34 株のゲノムデータから構築した系統樹と、
各株の由来（ヒトか食品か）、菌種、ST、CC、保有する van 遺伝子の種類
17
host food (n=38)
18
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20
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17
18
32
49
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157
179
192
249
314
363
444
463
489
547
631
669
1421
*79
E. faecium
E. faecalis
host human (n=33)
E. faecium
E. faecalis
図 18 食品由来株とヒト由来株における Enterococcus 2 種の割合
109
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Enterococcus spp.
2021 年に国立感染症研究所が受け入れてゲノム解析を実施した、食品（食肉衛生検査所および検疫
所由来鶏肉検体）から 2016 年から 2021 年にかけて分離された Enterococcus spp.38 株と、国立感染
症研究所薬剤耐性研究センターが日本各地の病院から 2019～2020 年に収集したバンコマイシン耐性腸
球菌（VRE）34 株のゲノムデータから構築したコアゲノム系統樹を図 17 に示した。菌種の内訳は、
Enterococcus gallinarum が 1 株（ヒト由来）と、Enterococcus faecium が 42 株、Enterococcus
faecalis が 29 株であった。E. faecium と E. faecalis は共に食品とヒトの両方から分離された（図
17、図 18）。E. faecium では、ヒト由来の VRE が全て CC17 に分類される一方、食品由来の株で
CC17 に分類されるものはなく、ヒト由来 VRE 株と食品由来株は系統的に分離していることが分かっ
た。E. faecalis でも、ヒト由来の VRE は ST6 か ST179 のいずれかに分類される一方、食品由来の株
では ST6 か ST179 に分類されるものはなく、Enterococcus spp.について、ヒト由来と食品由来の株
は系統的に分離していることが分かった。
VAN
CC
MLST
host
Species
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Species
MLST
E. faecium
E. faecalis
E. galinarum
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ヒト
食品
図 17
VAN
vanA
vanB
vanC
vanN
CC17
Enterococcus spp.の食品由来 38 株とヒト由来 34 株のゲノムデータから構築した系統樹と、
各株の由来（ヒトか食品か）、菌種、ST、CC、保有する van 遺伝子の種類
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host food (n=38)
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E. faecium
E. faecalis
host human (n=33)
E. faecium
E. faecalis
図 18 食品由来株とヒト由来株における Enterococcus 2 種の割合
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