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(４) 環境
一般的に、人的活動による汚物は下水処理場等の生活排水処理施設で排水基準まで処理されてその
排出水が排水基準に適合したときに環境（河川・海洋）へと放流される。ワンヘルス・アプローチに
基づく環境 AMR で注視すべき対象は、人的活動による汚物が下水処理場等の生活排水処理施設で排水
基準まで処理された排出水が排水基準に適合したときに環境（河川・海洋）へと放流される環境水の
中にどのような薬剤耐性菌（遺伝子）が存在し、我々の日常生活へどのように循環しリスクへと発展
しうるのかを評価することにある。

① 厚生労働省の厚生労働科学研究による結果
我が国における調査法の確立及び実態調査
現状、どの程度の薬剤耐性菌（AMR bacteria：ARB）およびそれらに由来する薬剤耐性遺伝子
（AMR gene：ARG）が環境へと排出され、その環境に負荷を与え続けているのかについて、定量的な
報告はわずかであり、系統だった全国調査が重要であることから、本邦における継続的な環境 AMR 調
査のため、厚生労働省科学研究「環境中における薬剤耐性菌及び抗微生物剤の調査法等の確立のため
の研究. 代表: 金森肇

H30-R02、R03-R05」（以下「金森班」という。）が編成された。平成 30 年度

～令和 2 年度の 3 年間において本研究班で環境 AMR モニタリングに資する手順書を作成し、環境水の
薬剤耐性菌及び残留抗菌薬の調査方法の確立に向けた研究を実施した。この研究によって放流処理水
の環境 AMR モニタリング調査を全国展開するための体制を構築し、地方自治体の環境負荷の実態が遺
伝子レベルで解明した。また、国内外の文献レビューを行い、環境中の薬剤耐性に関する現状と課題
を明らかにした。
平成 30 年度～令和 5 年度にかけて、次世代シークエンサーによる環境水から ARG 等の網羅的配列解
読法（メタゲノム解析）を構築し（国立感染症研究所・病原体ゲノム解析研究センター）、44 自治体
から提供を受けた下水処理場・放流処理水サンプル（2018 夏・８月、2019 冬・２月、2019 夏・8 月、
2020 冬・2 月、2020 夏・8 月、2021 冬・２月、2021 夏・8 月、2022 冬・2 月、2022 夏・8 月、2023
冬・2 月、2023 夏・8 月の計 656 サンプル）のメタゲノム解析を実施した。6 年間（計 11 回）の継続
調査の結果、新型コロナウイルス発生の影響と推定されるが、2019 年冬以降から ARG 総数が徐々に減
少傾向にある。サルファ剤（Sulphonamide）耐性遺伝子が 2020 年冬までは増加傾向であったところ、
2020 年夏で顕著な減少を示し、2023 年冬まで低い水準を維持していた。マクロライド耐性遺伝子は
2020 年冬に減少傾向を一旦示すものの、その後は新型コロナウイルス発生以前の水準にまで増加し戻
っていることが確認された。本研究で用いたメタゲノム解析法は世界的なメタゲノム解析法に準じて
おり、各国報告と比較する上でも重要である。引き続き、自治体の協力のもと年 2 回（夏および冬）の
全国調査を実施し、本邦の環境 AMR（Resistome）の基盤を整備していく予定である。
放流処理水の ARG に加え、環境で生存し増殖する可能性を有する ARB の存在を特定することは重要
である。金森班では、東京湾沿岸の水再生センターでの環境水中から、臨床で分離されることが少な
い KPC-2 産生肺炎桿菌 Klebsiella pneumoniae（Sequence type 11：ST11）を分離し、ST11 は東ア
ジアで広範に分離される臨床分離株と同一型であったこと 1、創傷感染症で稀に分離されるアエロモナ
ス属菌が KPC-2 を保有していたこと 2、NDM-1 よりも広域活性を獲得した NDM-5 カルバペネマーゼ
を保有する大腸菌が分離されたこと等を報告しており 3、国内事情が少しずつ明らかになりつつある。
また、大阪・淀川流域における病院排水、下水処理場の流入水・放流処理水、および河川水の包括的
な AMR 調査が実施され報告されている。オゾン処理されていない下水処理場の放流処理水から多様な

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