【資料2】薬剤耐性ワンヘルス動向調査年次報告書2024(たたき台) (97 ページ)
出典
公開元URL | https://www.mhlw.go.jp/stf/newpage_47987.html |
出典情報 | 薬剤耐性ワンヘルス動向調査検討会(第12回 1/8)《厚生労働省》 |
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図3
本邦の下水処理場(水再生センター)放流水のメタゲノム解析(Metagenomic DNA-Seq)
2018 年夏(18S)から年2回の調査にて 2023 年夏(23S)までの計 11 回の期間において自治体から提供された処理放流水から
検出された各種カテゴリーの薬剤耐性因子(ARG)を RPKM(Reads Per Kilobase of gene per Million mapped reads)で標準
化した。2018 年以降、ARGs データベースの更新が頻繁に行われているため、全検体から得たメタゲノムデータを改めて
ARGs_OAP v3.2.213 で ARGs の RPKM を算出した。
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